父・大井源四郎（和歌山県平民）。長男。大阪（京都とも）、長崎で蘭学と医学を学び、蘭学医となる。安政 5 年、長崎に留学中、写真術を研究している。松本良順、上野彦馬、内田九一、阿部徳次郎（亀谷徳次郎）等とも親交していた。慶応元年、大阪で開業。大坂歩兵屯所付き医師として伏見の役に参加、和歌山藩士に列せられる。また、大阪府仮病院（現・大阪大学医学部附属病院）医師となる。明治維新後、大学得業生、文部省助教を経て薬剤師となる。明治5年または明治６年、桑田正三郎は神戸で横田朴斎から写真術を学んだのち、京都までの帰路で大阪に立ち寄り、大井卜新、宮津賢治郎、葛城思風、田村景美、石橋松之助、和田猶松、石川文右衛門等に会い写真術の研究を重ねた。明治 9 年、大阪で薬局を開業。のち大阪府会議員となる。明治 37 年、衆議院議員に当選（三重県、立憲政友会）。 中外生命保険会社設立、硫酸肥料、伊和鉄道、大阪電灯などの重役、大阪商業会議所副会頭も務めた。明治 42 年、渋沢栄一のアメリカ実業界視察旅行「渡米実業団」に参加。大正13年、死去。著名な社会運動家の大井憲太郎は、文久3年に、長崎で蘭学・英学を学び、大井卜新との知遇を得て義兄弟となり、大井の名字を名乗った。長女の大井まつゑに養子・大井五十吉（大阪府平民、亡小松有藏長男）を迎えている。大井五十吉は薬剤商いを継ぎながら東洋紙工印刷（株）取締役 となった。
生年/出身： 1834 和歌山（紀伊国牟婁郡西山郷平、谷村、紀州領十津川）
開業年：
開業地、主要拠点： 大阪
師匠： 内田 九一
弟子： 桑田 正三郎
